桑普多利亚足球俱乐部是于1946年成立，是由意大利热那亚两家俱乐部合并而成。其前身包括了于1891年成立的桑普达雷内塞队(Sampierdarenese)，以及于1895年成立的安德雷亚.多利亚队(Andrea Doria)。这两家俱乐部后来于1946年合并，而成为今日的Unione Calcio Sampdoria，即桑普多利亚足球俱乐部。
80年代是桑普多利亚的全盛时期，曾三度夺得意大利杯冠军。1990年出战欧洲优胜者杯，决赛战胜比利时安德莱赫特队首次获得欧洲赛事冠军。1990/91赛季桑普多利亚队压倒米兰双雄、尤文图斯和卫冕冠军那不勒斯队，历史性首次登上意甲联赛冠军宝座。当时前锋线上有两位重量级球员──罗伯特·曼奇尼和詹卢卡·维亚利也因而成名，其后还招揽了不少星级战将，、恩里科·基耶萨、、克拉伦斯·西多夫、胡安·塞巴斯蒂安·贝隆等等。
其后数年球队无心恋战，战绩江河日下，阵中一众球星皆纷纷离队他投，1999年终于降落意乙联赛。至球队连续两年在乙组取得第五名成绩（首四名可升上甲组）后，2003年以乙级联赛亚军重返意甲。
桑普多利亚自2003年重返甲组以后一直较为稳定，排名处于中上游位置，主场长期以来颇具实力，上赛季主场排到前五，仅输给米兰和罗马两支强队，极佳的主场成绩也为球队顺利拿到下赛季欧洲联盟杯参赛资格。新赛季球队阵容变化主要来自于中场变化，帕尔玛新星德塞纳加盟，锋线上卡萨诺与老将贝卢奇的配合日趋成熟，07-08赛季两人合力攻入22球，两人的出色发挥将成为新赛季球队入球的保证。08/09赛季结束之际，带队两年的主教练马扎里宣布离开“水手”，俱乐部很快宣布前亚特兰大主帅德尔内里为新任主教练。德尔内里对阵容进行了大的变动，昔日马扎里的“352”被改造成了“442”。对于德尔内里来说，改打“442”意味着球队在边路需要多名突击手，但马扎里上赛季的“352”则更多地选择在中路进行短传渗透，边路突破荒废已久，能用的球员也不多，因此必须进行改造。为此，他将德尔维奇奥、德塞纳和萨马尔科三名中路球员清洗出队，年过三旬的边路球员皮耶里则因为突破不再犀利同样被出售，与此同时曼尼尼的加盟解决了德尔内里担忧的左路问题，曼尼尼居左，帕达利诺居右，桑普多利亚插上了“两只翅膀”。
如今在卡帕组合稳定进球率的带动下，桑普多利亚又恢复了上世纪末“巨人杀手”的本色。上赛季球队就曾给三大豪门制造过麻烦，在意大利杯中击败国际米兰，联赛中客场逼平尤文图斯，主场战胜AC米兰，卡帕组合都有进球入账；现在又在联赛中率先拿下了卫冕冠军，新赛季的意甲将是它重新崛起的时机。不惧怕豪强的“水手”没有欧战的困扰，专心于联赛将使他们更加强大，若说上赛季最大的黑马是热那亚，如今他们的同城对手桑普多利亚也已经迎头赶上，球队在新赛季的定位正是完成进军冠军联赛的目标。